Уголовное дело по факту хищения бюджетных средств неустановленными лицами из числа руководства Московского института стали и сплавов было возбуждено в 2009 году. Позже стало известно, что по делу проходят в качестве свидетелей бывший ректор МИСиС, министр образования Дмитрий Ливанов и экс-проректор МИСиС, первый замминистра образования Наталья Третьяк.
По информации ИТАР-ТАСС (со ссылкой на депутата Владимира Бурматова), следователи вновь приступили к разбирательству в деле.
По данным следствия, в ходе реконструкции одного из корпусов МИСиС было похищено 57 миллионов бюджетных рублей, выделенных на реконструкцию здания института. По данным следствия, эти средства были перечислены МИСиС на счета фирм-однодневок, которые не выполнили работы, за которые получили деньги.