Министерство внутренних дел Эстонии выразило недовольство внесёнными Эстонской православной церковью (ЭПЦ) изменениями в устав, посчитав их незначительными. Это стало известно из сообщения портала ERR, который ссылается на содержание письма канцлера МВД Тармо Мийлитса, адресованное епископу Тартускому Даниилу, викарию Таллинской епархии ЭПЦ.

По мнению Мийлитса, изменения, касающиеся переименования церкви и исключения упоминаний о Московском патриархате, Русской православной церкви (РПЦ) и патриархе Кирилле, остаются формальными и не влияют на реальное влияние РПЦ на ЭПЦ. Канцлер подчеркнул, что воздействие Московского патриархата как в административных, так и в канонических вопросах сохраняется. Он настоятельно рекомендовал руководству ЭПЦ заново пересмотреть устав, с целью полного устранения влияния РПЦ на управление и деятельность церкви.

Министерство отклонило предложение убрать из названия упоминание Московского патриархата, ссылаясь на несоответствие данного имени закону о церквях и приходах. Ведомство объяснило, что новое наименование слишком похоже на существующее название Эстонской апостольской православной церкви (ЭАПЦ) и может ввести в заблуждение, создавая впечатление, что церковь представляет всех православных верующих в Эстонии.

20 августа ЭПЦ утвердила обновлённый устав, устранив из названия ссылку на Московский патриархат. Однако МВД Эстонии выразило сомнения относительно утверждения нового её названия. 6 мая парламент Эстонии, Рийгикогу, назвал РПЦ организацией, оказывающей поддержку военной операции России на Украине. 16 мая министр внутренних дел надеялся на полное разрывание связей между ЭПЦ и РПЦ, а также осуждение Московского патриархата как еретического.

В ответ на действия Рийгикогу руководитель синодального отдела Московского патриархата по взаимоотношениям с обществом и СМИ Владимир Легойда обвинил МВД Эстонии в попытках ликвидации ЭПЦ и принуждении верующих к подчинению Константинопольскому патриархату. Вице-канцлер МВД, Райво Кюйт, ранее предложил храмам ЭПЦ Московского патриархата рассмотреть возможность присоединения к ЭАПЦ, находящейся под юрисдикцией Константинополя. МВД обещало принять окончательное решение по вопросу ЭПЦ к концу сентября, после анализа предложенных изменений в устав.