Мутации в наших генах могут привести к серьёзным проблемам, таким как рак толстой кишки или печени. Однако на самом деле онкология — это очень сложная дисциплина, поскольку мутации в одних и тех же генах могут привести к совершенно разным подтипам опухолей у разных людей. Это затрудняет прогнозирование и диагностику рака, а также исследование разных типов онкологии в лабораторных условиях.
Поэтому учёные из лаборатории Колд-Спринг-Харбор (США) решили изменить правила игры и, воспользовавшись технологией редактирования генов CRISPR-Cas9, создали совершенно новый метод моделирования типов рака. Методика основана на наблюдениях за разными формами белков, которые называются изоформами. Именно они производят различные типы опухолей во время процесса, известного как пропуск экзона.
Исследователи использовали CRISPR, чтобы воздействовать на один и тот же участок гена мышей, а затем наблюдали за тем, что получится. Итогом стало усиление активности белка, способствующего росту опухолей, которые команда секвенировала и выяснила, что, оказывается, разные изоформы вызывают особые типы рака.
Затем, чтобы подтвердить, что эти изоформы действительно вызывают отклонения, учёные воспроизвели их у мышей и обнаружили, что у зверьков развились два совершенно разных типа опухолей с соответствующими характеристиками. Оба этих типа относятся к агрессивному раку печени, который также встречается у людей. Команда надеется, что её открытие позволит лучше изучить разные изоформы, чтобы подобрать к каждому подтипу рака эффективное лекарство.